廢水處理菌種的死因可能包括：
1. 溫度過高或過低，導致生物活動能力下降或直接死亡。
2. 酸堿度失衡，影響生物菌的正常生長和代謝，從而導致死亡。
3. 氧氣過多或過少，缺氧或氧氣濃度過高都會導致生物菌死亡。
4. 污染物過于濃縮，過高的有機負荷和毒性物質會對污水處理生物菌造成損害和死亡。
5. 運行不當，如系統負載過重、污泥濃度過高、不能合理地進行曝氣、混合和攪拌操作等，都會導致生物菌死亡。
以上只是可能的一些原因，具體的死因還需要根據現場使用情況和廢水處理系統的具體情況進行判斷。
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